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高效基因测序 锁定致病元凶

图:国家超级计算深圳中心主任冯圣中在进行巡检/受访者供图  数据汇集只是第一步,更重要的是透过数据研究疫情发展趋势、分析病毒传播路线、明确高危人群状况,为下一步决策部署提供支撑。  冯圣中表示,基于疫情时空大数据,可以利用数学模型对新冠病毒的可能感染规模和传播风险等进行预测,为评估防控措施的有效性以及医疗、卫生资源的分配提供重要的参考价值。  透过海量的数据,科学家们正通过人口基数、流动趋势、时空分布等维度,深入研究疫情趋势分析模型,预测新增确诊人数拐点并形成分析报告,支撑国家卫健委疫情管控工作,为相关机构重点管控提供数据支撑。  此外,超级计算还能加速病毒基因测序,助力病毒突变预测。对病毒进行基因测序,通过基因相似性分析构建基因演化树,有助于定位致病元凶,并揭示病毒致病机理。「利用测序结果,采用生物信息学的方法来比对和查找,就需要超级计算资源。」冯圣中说。  在测序和序列分析初期,科学家发现新冠病毒和以前的冠状病毒相似度并不是特别高(87%),进一步通过基因家族分析和蛋白质三维结构分析,实现了致病元凶的准确定位,超级计算在其中发挥了不可或缺的重要支撑作用。 记者 郭若溪

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